Vỏ ngoài của sâm Ngọc Linh xù xì thô ráp do sinh trưởng trong điều kiện khắc nghiệt, bộ rễ chùm phân bổ dọc theo thân, rễ chính và rễ phụ đều bám và phát triển từ các đốt tuổi. Trong khi đó rễ tam thất thân trơn, có vẻ ngoài bóng mượt, ít rễ sợi phát triển.